Nowelizacja art. 90 ust. 10 ustawy o VAT (Dz.U. z 2004 r. nr 54, poz. 535 z późn. zm.) jest konieczna, ponieważ obecna regulacja jest niezgodna z Dyrektywą 2006/112. Problem dotyczy podatników, u których proporcja nie przekroczyła w danym roku 2 proc.

Obecnie tacy podatnicy objęci są zakazem odliczenia podatku naliczonego, natomiast po nowelizacji będą mogli zdecydować, czy chcą te 2 proc. odliczać czy nie.

Niezgodność obecnego przepisu z regulacjami Dyrektywy 2006/112, jako naruszającego zasadę neutralności VAT, została potwierdzona w wielu wyrokach NSA, ostatnio w wyroku z 23 lutego 2011. r. (sygn. akt I FSK 290/10). Zgodnie z utrwalonym w tym zakresie orzecznictwem Trybunału Sprawiedliwości UE, polscy podatnicy mogą w takim przypadku powoływać się bezpośrednio na przepisy dyrektywy i obliczać podatek na ich podstawie.

Podatnicy, którzy do tej pory stosowali zakaz i nie odliczali podatku naliczonego, mogą skorygować złożone deklaracje i wystąpić o zwrot podatku.

Niekorzystna będzie natomiast zmiana dotycząca podatników, u których proporcja przekroczy 98 proc., gdzie ogranicza się prawo do odliczenia całości podatku naliczonego, jeśli kwota, która zostałaby odliczona (a nie powinna) przekroczy 500 zł.

Zdaniem niektórych specjalistów, redakcja przepisu budzi duże wątpliwości, gdyż jeśli kwota podatku wyniesie 499 zł, podatnik będzie mógł odliczyć ją w całości, ale jeśli wyniesie 500 zł, to jej nie odliczymy.

Zmusi to wielu podatników do poniesienia kosztów wyodrębniania kwot podatku naliczonego, które będą znacznie wyższe niż 500 zł, ale bez ich poniesienia nie będą mogli dokonać prawidłowego rozliczenia VAT.

Zmiana ta nie będzie dotyczyć podatników, u których proporcja przekroczy 99 proc., gdyż wtedy zgodnie z przepisami wynosi 100 proc.

Zmiany w ustawie o VAT po uchwaleniu przez Sejm zostały przekazane do Senatu.

Źródło: GP